Ecologie des micro-organismes
Parcours : Parcours Plantes, Biologie Moléculaire et Biotechnologies
Organisation du parcours PBM-Biotech
Les 2 années (M1 et M2) sont organisées en 4 semestres de 30 crédits chacun :
- M1-Semestre 1 : de septembre à janvier
- M1-Semestre 2 : de janvier à mai
- M2-Semestre 3 : de septembre à décembre
- M2-Semestre 4 : de janvier à juin (ou septembre)
Description des UE dans la rubrique Cours ci-dessous.
- Cours (CM) 24h
- Cours intégrés (CI) -
- Travaux dirigés (TD) 12h
- Travaux pratiques (TP) 32h
- Travail étudiant (TE) 72h
Langue de l'enseignement : Français
Enseignement proposé : en présentiel enrichi de ressources pédagogiques numériques
Description du contenu de l'enseignement
Cette UE présente les outils et méthodes utilisés pour étudier l'écologie des micro-organismes ainsi que leurs applications dans différents contextes d'étude. Des travaux pratiques permettent de mettre en application les méthodes vues en cours. Les thèmes présentés dans l'UE sont :
- la méthylotrophie
- l'écologie des micro-organismes marins
- l'utilisation de la microscopie et des molécules fluorescentes
- l'utilisation des isotopes (Stable Isotope Probing, Compound-Specific Isotope Analysis ...)
- l'étude des communautés microbiennes (diversité, génotypage ...)
- l'analyse et la représentation de données (analyses multivariées)
Compétences à acquérir
- Maîtriser les outils d'études des micro-organismes et connaître leurs limites
- Concevoir une expérience permettant de répondre à une question scientifique, prévoir les contrôles et témoins nécessaires
- Analyse de façon critique des résultats d'expérience
- Savoir analyser un article scientifique et le restituer à l'oral
- Savoir choisir et appliquer une méthode d'étude de données adéquate en fonction du type d'information disponible
Pré-requis obligatoires
Les étudiant(e)s voulant suivre cette UE devront avoir suivi au préalable des enseignements en microbiologie et notamment en pratique.
Contact
Responsable
Thierry Nadalig